За семь месяцев 2016 года пассажиропоток в аэропорту Благовещенска снизился на 17,9 % по сравнению с аналогичным периодом 2015 года. Снижение этого показателя произошло из-за уменьшения пассажиров на внутренних линиях на 21,6 %. Причиной стала отмена рейсов по маршруту Москва – Благовещенск авиакомпанией Pegas Fly (Икар) с января по апрель, а также отмена рейсов по маршруту Красноярск – Благовещенск – Южно-Сахалинск авиакомпанией КрасАвиа.
Не смотря на общее снижение пассажиропотока в аэропорту Благовещенска, на международных направления произошло увеличение пассажиропотока на 18,2 % и составило 22 181 пассажир. Основной причиной такой динамики стал рост спроса у российских туристов на курорты Юго-Восточной Азии. Самыми популярными являются вылеты в аэропорты Пхукет (Таиланд) и НяЧанг (Вьетнам).
Для увеличения пассажиропотока на внутренних линиях ведется работа с региональной авиакомпанией Аврора. Так было открыто два новых маршрута с 2 мая Благовещенск – Хабаровск и 21 июля Благовещенск – Владивосток рейсы выполняются на самолетах DHC—8 Q400.